Lors d'une mission spéciale, une équipe de Skylanders a découvert un repaire secret où Kaos expérimentait une nouvelle découverte – Petrified Darkness – qu'il avait initialement l'intention d'utiliser pour organiser un coup d'État contre les Skylands.
Dans leur combat pour arrêter Kaos, le repaire a explosé, libérant un nuage de pures Ténèbres.
Les Skylanders savaient qu’ils ne pouvaient pas la laisser s’échapper, alors ils ont absorbé cette énergie, les transformant en versions sombres d’eux-mêmes. Heureusement, Spyro a appris à apprivoiser cette obscurité en lui il y a longtemps.
Ainsi, avec son aide, ces Skylanders ont désormais également appris à le contrôler, en combinant son pouvoir avec le leur pour combattre Kaos et les forces du mal.
