Dans Scooby Doo! et le marais effrayant, Scooby-Doo, Shaggy, Daphne, Velma et Fred sont dans une toute nouvelle aventure pour découvrir le mystère derrière une étrange fille des marais et son chaudron de bière. Les enfants et leurs amis peuvent voyager au-delà du marais et dans d'autres lieux hantés tels que le village alpin couvert de neige et la ville fantôme du sud-ouest pour découvrir plus d'indices et résoudre le mystère de l'étrange brasserie.