La Reine des Exoborgs a entendu le cri de détresse des abeilles, leurs lointaines cousines, sur la planète Terre. L'invasion est massive et soudaine et les armes humaines habituelles ne suffisent plus pour faire face à une menace qui, bien que minuscule, menace notre planète entière... Grâce à la recherche scientifique, et à un entrainement poussé, les Usatropodes représentent la réponse ultime, ou presque...
Micro Mutants est un jeu de puces avec des pouvoirs. À son tour, un joueur lance ses deux dés pour savoir quels types de Soldats il peut activer. Il fait sauter ses Soldats à l'aide d'un propulseur, pour recouvrir et éliminer les Soldats et les Bases adverses. Dès qu'un joueur a détruit les deux bases de son adversaire, il est déclaré vainqueur. Chaque armée dispose de pouvoirs spéciaux pour des stratégies uniques.