Medal of Honor quitte le théâtre de la Seconde Guerre mondiale pour la première fois en 11 ans d'histoire et entre dans le décor moderne de l'Afghanistan déchiré par la guerre vu à travers l'objectif d'un petit groupe de personnages fictifs.
De plus, les joueurs découvriront l'opérateur de niveau 1, un guerrier d'élite et un instrument relativement inconnu de l'armée américaine qui opère sous l'autorité de commandement nationale, prenant en charge des missions que personne d'autre ne peut gérer.
