LEGO Marvel Super Heroes propose une histoire originale traversant tout l'univers Marvel.
Les joueurs prennent le contrôle d'Iron Man, de Spider-Man, de Hulk, de Captain America, de Wolverine et de bien d'autres personnages de Marvel alors qu'ils s'unissent pour empêcher Loki et une foule d'autres méchants de Marvel d'assembler une super-arme capable de détruire le monde.
Les joueurs poursuivront les briques cosmiques en parcourant LEGO Manhattan et visiteront des lieux clés de l'univers Marvel, tels que la tour Stark, l'astéroïde M, une base Hydra et le X-Mansion.
