Gunpey DS est un puzzle-game. L'écran de jeu se divise en 5 colonnes, chacune étant traversée d'un ou plusieurs petits traits.
Le but de la manoeuvre consiste alors à déplacer ces segments verticalement afin de créer une ligne qui joigne les deux bords du tableau.
Gunpey DS offre différents modes de jeu ainsi que la possibilité de jouer à deux, pour peu que l'autre joueur dispose lui aussi d'une cartouche.
