Dans Cubic Ninja vous êtes CC, un courageux petit Ninja qui a la particularité d'avoir une forme carrée. Votre bien-aimée princesse et vos amis ninjas ont été enlevés. Vous devez les sauver !
S'il vous faut chuter jusqu'à avoir la tête qui tourne ou boire la tasse dans des eaux déchainées, et bien vous le ferez. Car vous êtes le courageux Cubic Ninja !